Тройка неизменных лидеров в течение многих лет: Московский государственный университет, Санкт-Петербургский государственный университет, Московский физико-технический институт (государственный университет).
Но, при этом стоит добавлять, что в России нет ни одного авторитарного рейтинга, государственного уровня, позволяющего объективно, в масштабах страны, оценивать все ВУЗы России. А существующие рейтинги, которые предоставляют свои версии лучших учебных заведений, являются исследования разных СМИ, аналитических компаний. А проблема создания государственного рейтинга существует давно, не раз поднималась на съезде ректоров, премьер-министром Путиным, но до сих пор, этот рейтинг еще не создан. Основная проблема: чтоб провести такое исследование в рамках страны (не забываем масштабы России), нужны большие средства, которых в данный момент не имеется.
Но, все-таки, Министерство образования и науки предоставляет свои списки «лучших», основываясь на тех данных, что присылают сами ВУЗы. Так, оценка составляется на основе таких критериев: профессорско-преподавательский состав (число докторов, докторов наук моложе 50 лет, кандидатов наук, членов РАН, число штатных преподавателей); научный потенциал ВУЗа (число защищенных диссертаций, объем госбюджетных работ, освоенных грантов на научные исследования, объем хоздоговорных работ). Но, положа руку на сердце, можно смело сказать, уровень полученных знаний по таким параметрам определить трудно. По мнению европейских и других мировых университетов, одним из самых главных критериев оценки ВУЗа является трудоустройство выпускников. Но, российские ВУЗы, такие сведения вообще не собирают. Так что, объективного и точного рейтинга российских учебных заведений нужно еще ждать, а по другим, частным рейтингам, лидеров мы уже озвучили.