Оценка эффективности экологической деятельности на АТП может быть выполнена двумя способами: на основе обобщения ряда частных оценочных показателей по отдельным мероприятиям природоохранной деятельности, проводимых на АТП, на основе экономической оценки эффективности мероприятий.
В первом случае экспертным путем определяются частные удельные показатели значимости отдельных природоохранных мероприятий. Например, значимость замены одного процента карбюраторных автомобилей дизельными, доля автомобилей оборудованных нейтрализаторами и т. д. В этом случае, оценка вклада каждого проводимого природоохранного мероприятия определяется произведением общего объема произведенного мероприятия на показатель значимости. Второй подход к оценке экологической деятельности на АТП предполагает расчет экономической эффективности отдельных мероприятий и суммирование результатов. В качестве оценочных показателей здесь могут быть приняты чистая текущая стоимость проекта, внутренняя норма окупаемости, соотношение выгоды/затраты.